1、不开放FTP，购买者无法得到网站程序和数据，这样就不能备份网站，将来也不能因为提供商服务不满意而转移网站；

2、不利于SEO优化，自助建站一般都没有考虑优化推广，仅仅能做展示所用；

3、操作并不简单，而且很多图片和内容无法修改，就算你有专业知识也无法通过修改文件的方式修改。

模板建站可以理解为自助建站，也有很多人现在把用CMS建站称为模板建站，因为CMS一般都是由程序和模板风格组成的，CMS建站是行业发展的必要趋势，因为CMS建站不仅可以节省成本，而且成熟稳定，可以根据行业的发展不断升级到最新版本，最主要的是功能强大，一般成熟的CMS把该考虑的问题都给你考虑进去了。

而如果是按照用户要求去开发网站风格即网站模板，CMS建站就和传统意义上的手工建站一样，而且价格、功能、安全等方面都优于传统建站方式。